Сам несколько раз "срывался" с учета и начинал все сначала, но в итоге пришел к выводу, что лучше все подкорректировать. Написать большой расход с категорией "прочее" и продолжить, ничего не обнуляя. Так что, мне кажется лучше скорректировать остатки на счетах, удалить лишнее и продолжать.